An image processing approach for corticospinal neuron mapping

The brain and the spinal cord that extends from it makes up the central nervous system whose main function is to transmit signals between the brain and the rest of the body. In this way, the nervous system's activity controls the ability to move, breathe, see, think, and more. The part of the nervous system which is in charge of the movements of the body is called the sensorimotor system. The basic unit of the sensorimotor system is a neuron. The human brain contains about 100 billion neurons which are formed by three main parts, these being the cell body, axons and dendrites, being the last two the parts allowing neurons to communicate between them forming several groups called motor nuclei. In this way, each neuron or group of neurons controls the activity of a specific muscle. Our aim is to obtain a complete representation about how the muscles project to the different neurons of the brain by studying the activated neurons for the different spinal cord sections thus obtaining a distribution map

Catalonia’s Cultural Diplomacy – A Story of total liquidation or a new beginning?

Catalonia’s para-diplomatic apparatus was hit hard when the Spanish government took control of the regional administration in the wake of the independence referendum of 2017. Since then, what was regarded by many as a successful model has mutated into a low-profile accommodating structure that is trying its best to steer through a storm of cumulative fines and pending legal cases while it avoids taking a central stage in national and international politics. The next two years will be key to see whether Catalan diplomacy retakes its place as a very particular international player trying to push a self-determination agenda or if it dissolves in a more mundane regional strategy

An Interactive Lifelog Search Engine for LSC2018

This thesis consists on developing an interactive lifelog search engine for the LSC 2018 search challenge at ACM ICMR 2018. This search engine is created in order to browse for images from a given lifelog dataset and display them along with some written information related to them and four other images providing contextualization about the searched one. First of all, the work makes an introduction to the relevance of this project. It introduces the reader to the main social problems affronted and the aim of our project to deal with them. Thus, go ahead with the scope of the project introducing to the main objectives fixed. Also, the work is gone by the actual state of the same kind of prototypes that already exist to let the reader see the differences that our project presents. After the project approach is done, it begins a travel trough the methodology and creation process, going deep in the main aspects and the explanation of every election and decision, also remarking the limits of the current prototype. Additionally, the project concludes with a result section where the system is tested with six users. They are asked to find three specific images using the search engine. This test is divided in two sections: first, a qualitative section where the user is asked to test the system and fill out a survey to see how comfortable it is for him. And a second section, more quantitative, where they value the speed of our system. Finally, the project concludes going through the actual and future ethics of lifelogging in general and with a final conclusion further investigation and future improvemen

An interactive lifelog search engine for LSC2018

In this work, we describe an interactive lifelog search engine developed for the LSC 2018 search challenge at ACM ICMR 2018. The paper introduces the four-step process required to support lifelog search engines and describes the source data for the search engine as well as the approach to ranking chosen for the iterative search engine. Finally the interface used is introduced before we highlight the limits of the current prototype and suggest opportunities for future work.Peer ReviewedPostprint (published version

Membrane association and contact formation by a synthetic analogue of polymyxin B and its fluorescent derivatives

sP-B is a synthetic analogue of the natural lipopeptide antibiotic polymyxin B (PxB) that maintains the ability of the parent compound to form vesicle-vesicle contacts and induce lipid exchange. Exchange is selective, and only monoanionic phospholipids such as 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-sn-3-phosphoglycerol (POPG) are transferred, whereas dianionic phospholipids such as 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-sn-3-phosphate (POPA) are not, as shown by fluorescence experiments based on the excimer/monomer ratio of pyrene-labeled phospholipids. Synthetic fluorescent analogues of sP-B are used to investigate the peptide position and orientation in the intermembrane contacts: sP-Bw, an analogue that contains D-tryptophan (D-Trp) instead of the naturally occurring D-phenylalanine, and sP-Bpy, incorporating a pyrene group at the N-terminus. Tryptophan fluorescence, anisotropy, and quenching measurements performed with sP-Bw indicate that the peptide binds and inserts in anionic vesicles of POPG and POPA. However, significant differences are seen depending on the lipid composition, as also demonstrated by fluorescence resonance energy transfer (FRET) experiments from Trp to 7-nitro-2-1,3-benzoxadiazol (NBD) groups at the interface. Intermolecular FRET using sP-Bw as the donor and sP-Bpy as the acceptor indicates self-association of the peptide, possibly forming dimers, when bound to POPG vesicles at concentrations that induce the vesicle-vesicle contacts

Diagnòsi socioambiental del Camí de Cavalls de Menorca : sector sud-oest

El Camí de Cavalls de Menorca és un camí rural que recorre tot el litoral de l'illa amb una extensió de 185 km. La primera referència escrita sobre el camí data de 1682 i ha tingut un ús tan militar com civil des dels seus orígens fins al final de la guerra civil espanyola (1939). A partir de llavors el camí va entrar en una fase de decadència i desús que va provocar a partir dels anys 80 una sèrie de mobilitzacions ciutadanes que van desembocar en la titularitat i gestió pública del camí des de l'any 2000. Aquesta posada en valor del camí i el seu patrimoni així com la gran importància del turisme en el camí i en el conjunt de l'illa fan necessària la realització d'aquest estudi per tal de determinar l'estat de conservació en el qual es troba el camí. En el present projecte s'ha realitzat un estudi de la qualitat de l'estat del sector sud-oest del Camí de Cavalls de Menorca a nivell ambiental i de l'opinió i percepció sobre el camí dels seus usuaris i principals actors implicats en el seu ús i gestió. L'any 2008 es va desenvolupar un sistema d'indicadors amb l'aplicació del qual es va fer una primera diagnosi de l'àmbit d'estudi i un dels objectius d'aquest projecte ha sigut una nova aplicació d'aquest sistema d'indicadors per a la seva revisió i comparació de resultats. Aquesta revisió s'ha ampliat amb la realització d'un inventari de punts afectats per l'erosió en el traçat del camí així com una caracterització de les tipologies d'erosió presents i la creació d'un mapa de susceptibilitat a l'erosió i un estudi sociològic a través de la realització d'una enquesta als usuaris del camí i d'una sèrie d'entrevistes a representants dels principals grups d'actors implicats en el seu ús i gestió. De l'aplicació d'aquests mètodes s'han obtingut una sèrie de resultats que es tradueixen en un bon estat de conservació del camí, 7 dels 13 indicadors han obtingut una valoració positiva en els 3 trams analitzats i només un té una valoració negativa als 3 trams, una percepció molt positiva per part dels usuaris i un conflicte sense resoldre entre els antics propietaris dels terrenys per on transcorre el camí i l'Administració. També és una problemàtica important i en augment l'erosió que afecta el camí (s'han inventariat 431 punts d'erosió al sector sud-oest), aquest és el camp on s'ha d'actuar més urgentment per a una futura bona conservació del camí. S'han proposat una sèrie d'accions de millora tant pel propi projecte com per a la gestió del camí.El Camino de Cavalls de Menorca es un camino rural que recorre el litoral de la isla con una extensión de 185 km. La primera referencia escrita sobre el camino data de 1682 y ha tenido un uso tanto militar como civil desde sus orígenes hasta el final de la guerra civil española (1939). A partir de entonces el camino entró en una fase de decadencia y desuso que provoco a partir de los años 80 una serie de movilizaciones ciudadanas que desembocaron en la titularidad y gestión pública del camino a partir del año 2000. Esta puesta en valor del camino y de su patrimonio así como la gran importancia del turismo en el camino y en el conjunto de la isla hacen necesaria la realización de este estudio para determinar el estado de conservación en que se encuentra el camino. En este proyecto se ha realizado un estudio de la calidad del estado del sector suroeste del Camino de Cavalls de Menorca a nivel ambiental y de la opinión y percepción de sus usuarios y principales actores implicados en su uso y gestión. En el año 2008 se creó un sistema de indicadores a través del cual se hizo una primera evaluación del ámbito de estudio y uno de los objetivos de este estudio ha sido una nueva aplicación de estos indicadores para su revisión y comparación de resultados. Esta revisión de ha ampliado con la realización de un inventario de puntos afectados por la erosión así como la caracterización de estos según su tipología y con la creación de un mapa de susceptibilidad a la erosión, así como un estudio sociológico a través de la aplicación de una encuesta a los usuarios y una serie de entrevistas con representantes de los principales grupos de actores implicados en el uso i gestión del camino. Fruto de la aplicación de estos métodos se han obtenido unos resultados que se traducen en un correcto estado de conservación del camino, 7 de los 13 indicadores han obtenido una valoración positiva en los 3 tramos estudiados y solo uno ha obtenido un resultado negativo en los 3 tramos, una percepción muy positiva por parte de sus usuarios y un conflicto sin resolver entre los antiguos propietarios de terrenos por donde trascurre el camino y la Administración. También es una grave y creciente problemática la erosión que afecta al camino (se han inventariado hasta 431 puntos afectados) y este campo es el que requiere más urgente actuación pata una correcta futura conservación del camino. Se han propuesto una serie de acciones de mejora enfocadas tanto en el propio estudio como en la gestión del camino.The Camí de Cavalls is a rural path that passes all around Menorca island with a length of 185 km. The oldest written reference known about the path is dated from 1682 and it had uses such as military and civil from its origins until the end of the Spanish civil war (1939). Since then the path was less used every time reaching a high degradation level at certain points, these facts caused serial social mobilizations that led to the public ownership and management of the path since the year 2000. This new conscience about the path natural and cultural values and the importance on tourism on the island make necessary this study to know which the conservation state of the Camí de Cavalls oh Menorca is. This Project has consisted on a quality analysis about the conservation state of the Camí de Cavalls (south-west sector) in Menorca at the environmental and social level, seeking for the different opinions and perspectives of its users and main management agents. A new indicator system was developed and applied on the path in 2008 with the objective of a first quality analysis. One of the actual project's objectives is to apply again this indicator system to see how the path environmental quality has changed in the last years. This analysis has been amplified with the creation of an inventory of erosion affected points of the path, a diagnosis of the erosive processes that are active on the field and the creation of a susceptibility to erosion map of the zone. Various interviews with the main involved agents of the path management have been done as well as a poll to the path users. The results obtained through the application of these methods tell us quite good news about the path environmental quality, 7 out of the 13 indicators results positively on the 3 analysed areas and only one indicator resulted negative on the 3 areas. At the social level the users rated very positively the Camí de Cavalls path and its surroundings, but there is still a confrontation between the landowners and the insular government. It is clear that the main problem and future threat to the path's quality is the growing erosion present on its layout (up to 431 affected points have been registered), it is urgent to take action on this problem to ensure its future preservation. Up to 15 proposals for actions have been designed to improve the path weak spots and the future reviews of this study

Administració, lluita i sobirania: anàlisi de la comunicació de l'independentisme català durant 2017

Programa de Doctorat: Traducció, Gènere i Estudis CulturalsEn aquest treball identifiquem els principals marcs (frames) històrics de l’independentisme català a través de l’anàlisi del discurs amb les eines de la construcció d’agenda de segon nivell i la lingüística cognitiva. A partir de l’anàlisi historiogràfic, proposem anomenar els marcs com a “administració”, “lluita contra la injustícia” i “sobirania”, i els numerar-los de l’1 al 3, en una classificació que definim com a grau de rupturisme. El grau de rupturisme ens permet classificar per després comparar quantitativa i qualitativament tots els missatges publicats a Twitter per les principals organitzacions i líders independentistes durant 2017. D’aquesta comparació se n’extreuen diverses conclusions, com que la majoria d’actors van rebaixar el seu grau de rupturisme a partir d’octubre de 2017. Pretenem que la nostra anàlisi serveixi per construir futures anàlisis comparatives del discurs de l’independentisme català o d’altres organitzacions i líders de qualsevol ideologia.In this work we identify the main historical frames used by Catalan secessionism through discourse analysis with the tools of second-level agenda-setting and cognitive linguistics. Drawing from the historiographical analysis, we propose to name the frames as follows: "administration", "fight against injustice" and "sovereignty", and number them from 1 to 3, in a classification that we define as degree of rupturism. The degree of rupturism allows us to classify and compare quantitatively and qualitatively all messages posted on Twitter by major pro-independence organizations and leaders during 2017. From this comparison several conclusions are drawn, one being that most actors de-escalated their degree of rupturism from October 2017. We intend our analysis to serve as a framework to construct future comparative analysis of the discourse of Catalan independence or of other organizations and leaders of any ideology

Exploratory analysis of a biological database (DEXA) and application of Machine Learning models to detect osteoporosis in HIV-positive patients

La incidència d'osteoporosi és major entre la població HIV+, per aquest motiu se'ls realitzen proves DEXA (densitometria òssia) de manera rutinària. Aquest treball s'ha centrat en estudiar una base de dades real, fruit de realitzar aquests anàlisis a pacients amb HIV. Les dades procedeixen de pacients que realitzen el seguiment de la malaltia a la fundació "Lluita contra la SIDA" (Badalona). És comú que les variables en un estudi mèdic no siguin independents, sinó que estiguin fortament correlacionades. Per això el primer apartat del treball s'ha centrat en purificar la base de dades i descobrir correlacions entre variables mitjançant gràfics de correlacions i mètodes més innovadors com els models gràfics (GGM i MGM). També s'ha aplicat un anàlisi de reducció de la dimensionalitat utilitzant components principals. En aquest primer punt s'ha corroborat la rellevància que té el gènere en l'estudi. En conseqüència s'ha realitzat tot el treball posterior per cadascun dels gèneres per separat. Els models gràfics apunten a que la importància de les variables relacionades amb les vèrtebres és trivial a l'hora de calcular el mínim T-score (i per tant, a l'hora de diagnosticar osteoporosi). La segona part de l'estudi s'ha centrat en generar models predictius capaços de diagnosticar osteoporosis sense utilitzar els marcadors clàssics. S'han aplicat varis algoritmes de Machine Learning (Random Forests, SVM, k-NN) i s'ha generat un model capaç de classificar noves observacions amb una sensibilitat i especificitat del ~80%.Osteoporosis incidence is notoriously larger in the HIV-positive population. For this reason, DEXA analysis (bone densitometry tests) are conducted as a control technique. This work focuses on studying a real DEXA database, retrieved from HIV+ patients doing medical checkups in the Lluita contra la SIDA Foundation, in Badalona. Medical databases often suffer from strong correlations between variables. For this reason, the first chapter of the study has been destinated to purify the database and discover said relationships, via correlation plots and more innovative techniques such as graphical models (GGMs and MGMs). Also, a dimensionality reduction analysis has been executed using principal components. This first part of the study corroborated the relevance of the gender variable. All the subsequent analysis has been conducted separately for men and women. Also, graphical models suggested that vertebral variables have a rather weak importance in determining the minimum T-score (and thus, predicting osteoporosis). The second part of the study has focused on generating a predictive model with the ability to diagnose osteoporosis without using its classical indicator variables. After modelling with various Machine Learning algorithms (Random Forests, SVMs, k-NNs), a classificatory model has been generated, reporting a sensitivity and specificity of ~80%.La incidencia de osteoporosis es mayor entre la población VIH +, de ahí que se les realizan pruebas DEXA (densitometría ósea) de manera rutinaria. Este trabajo se ha centrado en estudiar una base de datos real, fruto de realizar estos análisis en pacientes con VIH. Los datos proceden de pacientes que realizan el seguimiento de la enfermedad a la fundación "Lucha contra el SIDA" (Badalona). Es común que las variables en un estudio médico no sean independientes, sino que estén fuertemente correlacionadas. Por eso el primer apartado del trabajo se ha centrado en purificar la base de datos y descubrir correlaciones entre variables mediante gráficos de correlaciones y métodos más innovadores como los modelos gráficos (GGM y MGM). También se ha aplicado un análisis de reducción de la dimensionalidad utilizando componentes principales. En este primer punto se ha corroborado la relevancia que tiene el género en el estudio. En consecuencia se ha realizado todo el trabajo posterior para cada uno de los géneros por separado. Los modelos gráficos apuntan a que la importancia de las variables relacionadas con las vértebras es trivial a la hora de calcular el mínimo T-score (y por tanto, a la hora de diagnosticar osteoporosis). La segunda parte del estudio se ha centrado en generar modelos predictivos capaces de diagnosticar osteoporosis sin utilizar los marcadores clásicos. Se han aplicado varios algoritmos de Machine Learning (Random Forests, SVM, k-NN) y se ha generado un modelo capaz de clasificar nuevas observaciones con una sensibilidad y especificidad del ~ 80%

Administration, sovereignty and the fight against injustice: Identification and analysis of the discourse frames of modern Catalan secessionism

En aquest treball identifiquem els principals marcs (frames) històrics de l’independentisme català a través de l’anàlisi del discurs amb les eines de l’establiment d’agenda de segon nivell i la lingüística cognitiva, i els comparem amb exemples de 2017 per establir si són rellevants per a l’anàlisi acadèmica del discurs contemporani. Per identificar i descriure els marcs, hem analitzat alguns dels textos i discursos més rellevants de tres líders polítics que marquen la política catalana de la primera meitat del segle xx: Enric Prat de la Riba, Francesc Macià i Lluís Companys. A partir de l’estudi d’aquests discursos, identifiquem tres marcs que proposem d’anomenar marc d’administració, marc de sobirania i marc de lluita contra la injustícia.In this paper we seek to identify the main historical frames used by Catalan secessionism through discourse analysis using the tools of second-level agenda-setting and cognitive linguistics, and to compare them with examples taken from 2017 for the purpose of establishing whether these frames are still significant for the academic analysis of the contemporary discourse. In order to identify and describe the frames, we have analyzed some of the most relevant texts and speeches of three political leaders who marked Catalan politics in the first half of the 20th century: Enric Prat de la Riba, Francesc Macià and Lluís Companys. After studying this material, we propose that the frames should be called administration, sovereignty and the fight against injustice